小规模纳税人增值税征收率为0%，3%，不动产租赁5%，也就是说无论销售多少金额的商品和服务，都会按照3%（这里只考虑一般商品和服务）的征收率来缴纳增值税。
成本方面，小规模企业进货时一般会得到增值税普通发票，在税额那栏的数额，不能抵扣销售税金，这部分税金只能进入成本。所以小规模企业的增值税税负直接就是3%。无论经济环境如何，原材料价格上涨或下降，售价上涨或下降，征收率是不变的。
一般纳税人增值税税率0%，6%，11%，17%。分别适用不同的商品和服务。在销售商品时，会含有17%（这里特指一般商品）的增值税，但这并不是最终要交给税务局的，这里面还要扣除进货时付出的17%的增值税，才是最终负担的税款。那最终的税负会有多少呢？
举个例子，四个不同行业公司的毛利率分别是5%，10%，20%，50%，增值税率都是17%，税负分别为0.85%，1.7%，3.4%，8.5%，因此一般纳税人的毛利率越高，税负越高。当毛利率超过20%时，税负率已经超过小规模的征收率。很明显，毛利率高的行业直接申请一般纳税人是非常不划算的。
一般纳税人不能享受免征增值税优惠
根据国税总局2014年第57号公告，小规模企业才可以享受季度销售不超9万，免征增值税的优惠，小规模企业在税务局代开的专用发票不免增值税，当有退票或红冲时可以申请退回税款，但这项免税不包含一般纳税人企业（属于小微的），假如成立初期业务比较少，毛利高，税负比小规模企业高，这样就不划算了。
小规模企业不利于对外拓展业务
一般纳税人也是企业信用和实力的代表，对于客户来说同样的价格，可以获得专用发票还可以抵扣增值税，更为有利。以上仅是简单几点，其实小规模还是一般纳税人都各有利弊，企业一定要根据自己的业务需求和特点来决定，一但成为一般纳税人就不能更改。
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