二者从定义上存在区别。商标转让是指商标注册人在注册商标的有效期内，依法定程序，将商标专用权转让给另一方的行为。转移的是商标的所有权，商标转让后转让人不享有处置商标的任何权利。 商标合法持有人通过向国家商标局备案允许他人使用其注册商标的行为称为商标使用许可。商标合法持有人通过向国家商标局备案允许他人使用其注册商标的行为称为商标使用许可。
举例来说，商标假如是一座房子，商标转让是将房子作为二手房交易卖掉;商标许可是将房子使用权出租出去，房主还是房东本人。
准备材料不同
商标转让和商标许可在申办过程中，需要提供的材料不同。
商标转让需要提供：《转让申请/注册商标申请书》;转让人和受让人的身份证明文件(复印件);委托代理的提交受让人出具的《代理委托书》，直接在受理大厅办理的提交受让方经办人的身份证原件和复印件。
商标许可所需资料：商标使用许可合同备案申请书;许可人、被许可人主体资格证明文件;许可人签署的商标代理委托书;双方签章的商标许可使用合同原件或经公证的复印件;商标注册证复印件或商标档案信息。
优势不同
商标转让和商标许可哪种方式对于企业来说是最好的选择呢？
商标许可根据授权使用的期限缴纳使用费用，而商标转让则根据双方达成合作意向一次性缴纳转让费用，亦即购买商标的转让费用。
商标许可若是一标多人使用的情况，很有可能造成同行业的恶性竞争，造成不必要损失，而商标转让的可靠性和安全性则最高，通过商标转让取得商标也是比较稳妥的途径。其中，商标许可引发争端的最典型案例，便是某凉茶商标争夺战。
因此，商标转让很好的避免了近似商标情况的出现，也帮助企业避免可能出现一标多人使用的情况。
企业在申请办理商标转让过程中，可以提供免费商标查询，可以帮助客户协助准备、撰写商标转让申请材料，提交到商标局受理到下发转让受理通知书需要1-2个月的时间，再经过4-6个月是商标局审查公告时间，最后下发商标转让核准证明。
