生殖器疱疹的潜伏期通常为2-12天，平均约4-5天，部分患者可能长达数周。该病由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，潜伏期长短与病毒类型、免疫状态等因素相关。
1.病毒类型影响潜伏期
HSV分为1型和2型，HSV-2型导致的生殖器疱疹潜伏期更短，症状更明显。HSV-1型通过口腔接触传播至生殖器时，潜伏期可能延长。病毒载量高低直接影响潜伏期，初次感染病毒量较大时，3天内即可出现症状。
2.免疫系统决定反应速度
艾滋病患者或长期服用免疫抑制剂者，潜伏期可能延长至20天以上。健康人群接种流感疫苗后，暂时性免疫功能增强可能缩短潜伏期。压力、熬夜等导致免疫力下降时，会加速病毒复制使潜伏期缩短30%。
3.感染途径造成差异
直接黏膜接触感染的潜伏期比皮肤接触短2-3天。女性因生殖道结构特殊，平均潜伏期比男性长1-2天。重复感染同型病毒时，因体内存在抗体，潜伏期可延长50%。
4.识别早期症状
潜伏期后期可能出现针刺样瘙痒的前驱症状。腹股沟淋巴结肿大常早于皮损2-3天出现。部分患者潜伏期伴随低热（37.5-38℃）、肌肉酸痛等全身症状。
5.潜伏期检测方法
PCR核酸检测在感染后48小时即可检出病毒。IgM抗体检测需等待5-7天才能显示阳性结果。病毒培养法检出率随潜伏期推进逐渐升高，第3天阳性率约60%。
潜伏期患者已具备传染性，安全套不能完全阻断病毒传播。确诊感染后，阿昔洛韦等抗病毒药物需连续服用10天，配合外用喷昔洛韦乳膏可缩短病程。保持患处干燥，穿纯棉内裤减少摩擦，避免性生活直至症状完全消失后1周。定期复查HSV抗体水平，复发期间病毒载量检测可预测下次发作时间。
